از بارزترین تفسیرهای باطنیه می‌توان به تفسیر رمزی حروف مقطعه و همچنین تفسیرهای اسماعیلیه اشاره کرد. از باطنیان تفسیر کاملی به جای نمانده است. تنها تفسیر برخی از آیات است که در کتاب‌های کلامی و دیگر تفسیرها به صورت پراکنده به چشم می‌خورد.
شاید باطنیه چون نخواسته‌اند حتی تاویل دلخواه را محدود سازند و می‌خواستند حقعدول از اقوال را برای خود حفظ کنند، به تفسیر مدون و غیرقابل تغییر نپرداخته‌اند.
