بانی مدرسه آخوند خراسانی، آخوند خراسانی، از مراجع بزرگ شیعه است که با مساعدت مالی جان میرزا، وزیر سلطان عبدالاحد بخاری، زمین مدرسه را خریداری و ساختمان آن را بنا کرد. مساحت مدرسه، ۷۳۰ مترمربع و دارای ساختمانی دو طبقه، پیرامون حیاط مرکزی است. در سال ۱۳۸۵ ه. ق، فرد نیکوکاری از اهالی تهران، منزلی را در شمال شرقی مدرسه خریداری کرد و به فضای مدرسه افزود و سپس مدرسه را در سه طبقه بازسازی و نوسازی کرد.